ЭЛЕКТРОННО-КОНФОРМАЦИОННЫЕ ВЗИМОДЕЙСТВИЯ И ДИНАМИКА БИОПОЛИМЕРОВ

ЭЛЕКТРОННО-КОНФОРМАЦИОННЫЕ<br />
      ВЗИМОДЕЙСТВИЯ И ДИНАМИКА БИОПОЛИМЕРОВ

Задача молекулярная динамика биополимеров в задаче использованы как стандартные, так и оригинальные средства молекулярной динамики и компьютерной графики. Цель задачи демонстрация возможностей метода молекулярно динамического вычислительного эксперимента для изучения свойств биополимеров и роли различных видов взаимодействия в формировании структуры и динамического поведения биомакромолекул.

Сравнение методов молекулярной динамики, ланжевеновской динамики и монте карло сравнительное изучение авто и кросскорреляционных функций, а также карт уровней свободной энергии. Литература.

1. Шайтан к. В.

, рубин а. Б. Конформационная подвижность и теория эффекта мессбауэра в белках (модель броуновского осциллятора с сильным затуханием для конформационных мод).

Мол. Биол. 1980.

Т. 14.

С. 1323 1335. 2.

Шайтан к. В. Эффект мессбауэра для броуновского осциллятора с сильным затуханием и внутренняя динамика макромолекул.

Вестник моск. Ун та, сер.

3,физ.астр.

1982. Т. 23.

С. 15 21. 3.

Шайтан к. В.

, рубин а. Б. Конформационная динамика белка и простейшие молекулярные машины.

Биофизика, 1982. Т.

27. С.

386 391. 4.

Шайтан к. В.

, рубин а. Б.

Уравнение движения для конформона и простейшие молекулярные машины для электронного (ионного) транспорта в биологических системах. Мол. Биол.

1982. Т.

16. С. 1004 1018.

5. Шайтан к. В.

, рубин а. Б.

Взаимодействий. Мол.

Биол.1983,т. 17,6,с.

1280 1296. 6.

Шайтан к. В.

, упоров и. В. К теории диффузии в структурированных средах.

Химическая физика,1984,т. 3,10,с.

1416 1426. 7.

Шайтан к. В. упоров и.

В. рубин а. Б.

Теория миграции лигандов в белках. Мол.

Биол.1985,т.

19,3,с. 742 750.

8. Шайтан к. В.

, рубин а. Б.

В белках. Биофизика,1985,т. 30,3,с.

517 526. 9.

Крупянский ю. Ф. шайтан к.

В. в. И.

, и. В.

, рубин а. Б.

, суздалев и. П.

Исследование динамики белков методами мессбауэровской спектроскопии. Биофизика,1987,т. 32,5,с.

761 774. 10. Basovets s.

K. uporov i.

V. k. V.

, yu. F.

, kurinov i. V.

, suzdalev i. P. rubin a.

B. goldanskii v. I.

Biopolymer coordinate correlation functions. Hyperfine interactions,1988,v.

39,p. 369 378. 11.

Rubin a. B.

, shaitan k. V. kononenko a.

A. chamorovskii s.

K. Conformational dynamics of chromatium reaction center complexes.

Photosynthesis res.1989,v.

22,p. 219 231. 12.

,..

,. в.

Я. суздалев и.

П. Мессбауэровских спектров.

Химическая физика,1989,т. 8,5,с. 694 698.

13. Упоров и. В.

, басовец с. К.

, шайтан к. В. макаров е.

Ф. рочев в.

Я. Температур, фурье спектроскопии. Химическая физика,1990,т.

9,1,с. 21 28. 14.

Шайтан к. В.

, упоров и. В. лукашев е.

П. а.

А. а.

Б. Фотосинтезирующих бактерий. Мол.

Биол.1991,т.

25,3,с. 695 705. 15.

Шайтан к. В. Механизмы функционирования биомакромолекул.

Мол. Биол.

,1992,т. 26,2,с. 264 284.

16. Панченко а. Р.

, шайтан к. В.

О механизме влияния давления на внутримолекулярную динамику белков. Мол. Биол.

,1992,т. 26,5,с.

1116 1121. 17.

Панченко а. Р. шайтан к.

В. Подвижности, определяемые методом мессбауэровской спектроскопии. Биофизика,1992,т.

37,6,с. 1029 1034.

18. Макаров в.

А. шайтан к. В.

Электрона и параметры электронно колебательного перехода. Биофизика,1992,т.

37,6,с. 1048 1053.

19. Яшин в.

В. шайтан к.

В. Подвижности белков.

Химическая физика. 1993.

Т. 12. С.

204 209. 20.

Упоров и. В. шайтан к.

В. Данным мессбауэровской спектроскопии. Физика.

1993. Т. 12.

С. 240 248. 21.

Рубин а. Б.

, кононенко а. А.

, шайтан к. В.

, пащенко в. З.

, ризниченко г. Ю.

Транспорт электронов в фотосинтезе. Биофизика. 1994.

Т. 39.

С. 213 235. 22.

Шайтан к. В. Элементарных актов переноса массы, трансформации энергии и информации в биомакромолекулярных структурах.

Мол. Биол.

1994. Т.

28. 670 678.

23. Шайтан к.

В. Физическим механизмам функционирования биомакромолекул.

Биофизика. 1994. Т.

39. С. 949 967.

24. Шайтан к. В.

С конформационной подвижностью. Известия ран, сер. Физич.

1995. Т. 59.

С. 184 189. 25.

Shaitan k. V.

The topological structure of hypersurfaces of conformational energy levels and physical mechanisms of internal proteins mobility. Macromolecular symp.

1996. V.

106. P. 321 335.

26. Ермолаева м. Д.

, шайтан к. В.

Особенности строения гиперповерхностей уровней конформационной энергии и динамика полиаланина. Биофизика.

1996. Т.

41. С.

1168 1175. 27.

Балабаев н. К.

, лемак а. С. шайтан к.

В. Молекулярная динамика и электронно конформационные взаимодействия в ферредоксине. Молекулярная биол.

1996. Т.

30. C.

1348 1356. 28.

Шайтан к. В.

, балабаев н. К. Лемак а.

С. Ермолаева м.

Д. Ивайкина а.

Г. Орлов м.

В. Гельфанд е.

В. Молекулярная динамика олигопептидов.

1. Использование длинных траекторий и высоких температур для определения статистического веса конформационных подсостояний.

Биофизика. 1997. Т.

42. 47 53.

29. Шайтан к. В.

, немухин а. В. фирсов д.

А. богдан т.

В. тополь и.

А. Электронно конформационные взаимодействия и значение эффективных зарядов на атомах в пептидах. Мол.

Биол. 1997. Т.

31. 109 117. 30.

Шайтан к. В. ермолаева м.

Д. балабаев н. К.

, лемак а. С.

,.

Комментирование и размещение ссылок запрещено.

Комментарии закрыты.